基因是否会转录，进而表达蛋白，是受到调控或者条件限制的，如抗性基因必须是在培养时有抗性压力（如培养基中添加抗生素）时，才得到转录和表达，如果没加抗生素，就只会有极少的泄露表达（也可认为是没表达）；常见的lacZ启动子，也需要有IPTG诱导，才会得以转录。

所依工程质粒都是有转录能力的，但如果开关没打开，就不会开启转录。