漠河县年平均气温在零下5.5摄氏度，各月平均气温在0摄氏度以下的月份长达8个月，气温年较差为49.3摄氏度，平均无霜期为86.2天，年平均降水量为460.8毫米，全年降水量百分之七十以上集中在7月份，5至6月份为旱季，7至8月份为汛期，太阳辐射总量年平均为96至107千卡每平方厘米，日照时数为2377至2625小时，大于等于10摄氏度的积温为1436至2062摄氏度。