水平公平就是个人与同级之间的公平。垂直公平就是个人与上下级之间的公平。“公平”与“水平”，是个可以永远争论的话题。在科研管理中的做到“公平”，并借助公平获得科研“水平“的不断提高，其实是最体现管理者“水平”的。

一般而言，纵向公平要比横向公平更为复杂，其原因在于纵向公平是以不同的方式对待条件不同的人，不仅要判断纳税人的经济能力或纳税能力应是相同的，即横向公平，而且还必须有某种尺度来衡量不同纳税人的经济能力或纳税能力。