1、医保卡余额第二年不会被清零。

2、职工基本医疗保险每月底要结算，参保人停保，医保卡功能会停用，但医保卡账户余额不会被清零。医保卡账户也是个人账户，分当年账户跟历年账户，一年12个月金额提前打入当年账户，以参保人6月份停保为例，当年账户余额会结算到6月份，加上历年账户余额都会保留在账户内，参保人恢复参保时，余额会自动累计。